IS05 -  Istraživačka skupina za T-staničnu biologiju, imunogenomiku i imunofenotipizaciju

Voditelj istraživačke skupine

izv. prof. dr. sc. Stana Tokić

Opis istraživanja

Istraživačka skupina za T-staničnu biologiju, imunogenomiku i imunofenotipizaciju proučava ulogu konvencionalnih i nekonvencionalnih T-staničnih populacija u upalnim, autoimunim i zloćudnim bolestima, s naglaskom na imunološki mikrookoliš kože i sluznica. Posebna pažnja posvećena je MAIT i γδ T limfocitima, no istražujemo i druge T-stanične linije, s ciljem imunogenomske i funkcionalne karakterizacije krvnih i tkivnih populacija, njihove fenotipske i transkriptomske raznolikosti te analize repertoara T-staničnih receptora (TCR), pri čemu dodatno pratimo učinke biološke terapije na preoblikovanje fenotipa, transkriptoma i klonalne arhitekture TCR repertoara tih populacija.

U području tumorske imunologije, razvijamo modele istraživanja mikrookoliša melanoma, kombinirajući analizu fenotipskih obilježja i prostorne raspodjele tumor-infiltrirajućih limfocita, mutacijskog opterećenja tumora te cjelogenomskog transkriptoma i TCR repertoara, s ciljem razumijevanja evolucije tumora, mehanizama terapijske rezistencije i povezanosti genetskog opterećenja s imunološkim odgovorom.

U metodološkom smislu, naša istraživanja objedinjuju:

• tehnologije sekvenciranja nove generacije (NGS), uključujući sekvenciranje ciljnih mutacijskih i genskih panela, jednostanično i populacijsko RNA sekvenciranje te sekvenciranje TCR repertoara,
• višedimenzionalno fenotipsko profiliranje pomoću spektralne i protočne citometrije, te fluorescencijom aktiviranog sortiranja stanica (FACS) i,
• napredne statističke i bioinformatičkie analize,

omogućujući sveobuhvatnu funkcionalnu i molekularnu karakterizaciju imunoloških populacija.

Kroz međunarodnu suradnju sa Sveučilištima u Pečuhu, Olomoucu (Češka) i Warwicku (UK) razvijamo zajedničke istraživačke pristupe, a u okviru prekograničnih projekata, sudjelujemo i u razvoju digitalnih rješenja za kronične nezarazne bolesti (Interreg BloodRheoApp).

Cilj naših istraživanja je identificirati rane molekularne okidače, biljege progresije i imunološke obrasce koji reguliraju razvoj, napredovanje i terapijski odgovor upalnih, autoimunih i zloćudnih bolesti, s potencijalnom primjenom u razvoju novih terapijskih ciljeva i preciznijih dijagnostičkih alata.